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    人工智能结(jié)合医学(xué)影像助力“狙击”疫情

    2020/04/11739

    人工智(zhì)能结合(hé)医(yī)学影像领域助力“狙击”疫情

    从(cóng)春节前(qián)期武汉发现新(xīn)冠状病(bìng)毒到现在,已经几个月过去了,我国疫(yì)情已(yǐ)经(jīng)得到稳定控制,但是,新冠状(zhuàng)病毒(dú)已经在(zài)全球各大地区蔓延(yán),到(dào)目(mù)前(qián)为止(zhǐ),还在(zài)不断增加,感染的国家在增加,感染人(rén)数也在(zài)不断增加,人数(shù)越来(lái)越庞大。

    控制(zhì)疫情刻不容缓,大规(guī)模的筛查和检测是防(fáng)控的(de)关(guān)键(jiàn):包括X射(shè)线和CT在内的(de)医学影像技(jì)术在抗击疫情的过程中起到了(le)至关重要(yào)的作(zuò)用,而人工智能(néng)则大幅(fú)度提升了医学影像工具的能(néng)力和效率。来(lái)自上海联影、上海大学(xué)、剑(jiàn)桥大学等机构(gòu)的研究人(rén)员对AI结合医学影像领域在疫情中的应用进行了回顾和总结,从无接(jiē)触数据采集、工作流(liú)程重塑和定量医学影像分析等(děng)方面进(jìn)行了阐述,展(zhǎn)现了AI在抗击疫情(qíng)过程中不可或缺的重要作(zuò)用。

    基于(yú)医学(xué)影像(xiàng)的检测(cè)至(zhì)关重要

    目前全(quán)球(qiú)报告的疫情感染(rǎn)者已经超(chāo)过150万人,而有效的大规模检测是防控疫情的关键所在。目前广泛使用(yòng)的(de)是逆转录聚合酶链反应(RT-PCR,核酸检测),借助生物工程的强大能力(lì)成为了(le)我国(guó)在抗击疫情(qíng)中(zhōng)的(de)有(yǒu)力武器。但RT-PCR方法却在世界上很多国家面临检(jiǎn)测(cè)试(shì)剂不足、检测能(néng)力不足的(de)困(kùn)扰,同时还受到(dào)质量(liàng)问(wèn)题的影响。不仅如此,还有(yǒu)研究(jiū)表(biǎo)明,实验中存在着(zhe)较高的(de)假阴性率。

    好在医(yī)务(wù)人(rén)员在临(lín)床试验中(zhōng)利用的包括X和CT的医疗影像设备为肺炎的诊(zhěn)断提供了有效帮助。我(wǒ)国的(de)经验表明,如(rú)果在CT中观察到了肺部的相应病理特征,很多病例将会被(bèi)认(rèn)定为疑似病例,即使没有临床症状(zhuàng)也(yě)要进行(háng)隔(gé)离。鉴(jiàn)于(yú)核酸检(jiǎn)测的准确性仍待提(tí)高,疑(yí)似患(huàn)者(zhě)需(xū)要隔(gé)几天(tiān)进行多次(cì)检测以确(què)定诊(zhěn)断(duàn)结(jié)果。这时候,基于医学影像的(de)手段在防控病毒传播(bō)的过程中就发(fā)挥了(le)重要(yào)作用。

    以胸部CT为例,基于医学影像的疫情诊(zhěn)断(duàn)流程通常包括三个(gè)阶段,即(jí)扫描(miáo)前(qián)准备、医(yī)学影像获取和(hé)分(fèn)析诊(zhěn)断。人(rén)工智(zhì)能作为医学影像领域的新兴技术,与高度依赖人工的传统成像工作流程相比,可提供更安(ān)全、准确、高效的成(chéng)像解决方案。在接下(xià)来的报告(gào)中(zhōng),有用(yòng)于疫情的(de)智能医学影(yǐng)像平台和工(gōng)作流程中流行的机(jī)器(qì)学习方法,以及一些公开可(kě)用的(de)数据集。

    人(rén)工智能赋能无(wú)接触医(yī)学影像诊断流程

    医务人员在抗击疫情的过(guò)程中冲在了第一线,采集医(yī)学影像的过程中不(bú)可避免地要(yào)接触(chù)潜在患者。传统的成像过程中,患者(zhě)需要在医务人员的帮助(zhù)下(xià)调整和定位身体,协助患者摆好合适(shì)的姿势,在密切接触过程中暴露在病毒下的(de)风(fēng)险很高;相(xiàng)比之(zhī)下,非(fēi)接触式(shì)自(zì)动成像工作流程可以将(jiāng)医患间的接触和感染风险降低到最小。

    目(mù)前(qián)很多X光和CT设备都配备了用于监护患(huàn)者(zhě)的(de)摄像头(tóu),它(tā)们为非接触式的医(yī)学影像采集提供了设备(bèi)基(jī)础。工作(zuò)人员可以利用摄像头观察和指导患者的位姿。但仅凭摄像头的2D视(shì)角(jiǎo),研究人员无法有效判断(duàn)需要(yào)的测量范围和扫(sǎo)描参数。这(zhè)时候基于AI的(de)方法可以(yǐ)识别出患(huàn)者的姿势和形(xíng)状,而(ér)在(zài)算法的(de)帮助(zhù)下,RGB相(xiàng)机TOF传(chuán)感器等就能提(tí)供患(huàn)者的姿态信息,以帮助医生确定最佳扫描参数——例(lì)如从(cóng)图像中检测(cè)患者身体(tǐ)关键点,包括颈部、肩膀、肘部、脚踝、手腕和膝盖等等。

    实践表(biǎo)明(míng)这种(zhǒng)方(fāng)式可以有效减少不必要的职(zhí)业暴露。除了通过关(guān)键点和人体三维模(mó)型定义扫描参数外,AI还(hái)可以对齐患者与扫描中(zhōng)心、减小放(fàng)射剂量(liàng)、提高成(chéng)像质量。此外,它还能使用基于参数化人体(tǐ)模型的方法(fǎ)来有效解决遮挡和(hé)关键点精(jīng)度,有效推断出患者的3D姿态。

    更准确(què)的(de)人体定位和参数化测量使准确、无(wú)接触(chù)的医学影像(xiàng)检测(cè)成(chéng)为可能(néng)。下图(tú)展示了无接触影(yǐng)像采集的例子:

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    这是典型的无(wú)接触扫(sǎo)描流(liú)程,是(shì)基于移(yí)动(dòng)CT平台在AI的帮助(zhù)下实现自动化无接(jiē)触影像采集的(de)流程。其中扫描室和控制室完全独(dú)立,避免了医(yī)务人员与患(huàn)者(zhě)的不必要接触,患者则在工作人员视觉监测和声音指导下调(diào)整姿势(shì)。同时,基于3D位(wèi)姿估算(suàn)和AI得到的网格模型,也可以估计患者身(shēn)体部位、扫描范围和中心线,从而转换为(wéi)控制信号的扫描参数。当然必要的时(shí)候,技术人员还可以(yǐ)对参数进(jìn)行调整(zhěng)。在参(cān)数得到验证后,CT将患者对(duì)准设备ISO中(zhōng)心并移入(rù)CT龙(lóng)门进行扫描。采(cǎi)集CT图(tú)像后(hòu),在算法的(de)辅助下,医(yī)务人员将对其进行处理和分析,以进行筛查和诊断。

    AI赋(fù)能(néng)的医学影像处理(lǐ)

    目标(biāo)检(jiǎn)测和(hé)分(fèn)割是肺炎检测中的必(bì)要步骤。医生(shēng)需要对胸部医学(xué)影像中(zhōng)的(de)目标区域(包(bāo)括肺部、肺叶、支气管等位置和(hé)感染、病变区域的(de)定位等)进行描绘,以支撑后续的定量评估。目前的(de)技术主要(yào)是(shì)基(jī)于U-Net及(jí)其变体模型进行目标区域(yù)分割。下表展示了目前应用于COVID-19分割(gē)的深度学习方法:

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    针对肺部(bù)区域和肺部病变(biàn)进行(háng)检测(cè)和(hé)分割是研究的重(chóng)点(diǎn):一方面需要从医学影像中分(fèn)离(lí)出(chū)肺部区域,同(tóng)时(shí)还需要从肺(fèi)部区域中分离出病变区域。目前(qián)主要报道的文献中使用了最为经典的U-Net架(jià)构以及更为复杂的U-Net++模型,还有包含残差结构的V-Net和注意力机(jī)制来获(huò)取更为精细的肺部(bù)结构(gòu)和病变(biàn)区域。

    但另一个问(wèn)题是,训练强大的分割网(wǎng)络需要充足的(de)标记数据,而在(zài)疫情中,通常还无法(fǎ)获得充分(fèn)的标记数(shù)据。为解决这一问(wèn)题,研究人员将人类知识结合到了检测流程中。有的(de)学者将人类决策(cè)放入了训练VB-net模型的闭环中(zhōng),加入(rù)了放射科医(yī)生的(de)交互。还有研究(jiū)人员利用放射科医生给出的初(chū)始种子来(lái)辅助U-Net识别感染区域(yù)。此外,还(hái)有人使用了包括(kuò)注意力机制和弱监督学习的方法来进(jìn)行训练。

    精确的感染区域分割可以对感染程度进行量化(huà),让(ràng)医生能更全面地了解到有关患者病情严重程度的信息。同时,提取肺部感染区域(yù)的特征也可对患者的住院时间和诊(zhěn)疗(liáo)方案进行一(yī)定的辅助预测。

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    AI辅助(zhù)的诊断

    在获得了有效的医学影像(xiàng)后,需(xū)要专家来对病人(rén)的病情进行诊断。但在(zài)流行(háng)病爆发的当下,医疗资源(yuán)的严重(chóng)匮乏(fá)使得准确高效的诊断变得困难(nán)。不(bú)仅(jǐn)由于诊断需要花(huā)费大量时间,还因为(wéi)疫(yì)情(qíng)与其他肺炎的相似表现需要医(yī)生具有丰富的经验和诊断能力。而AI则可以辅助医生对(duì)病人病(bìng)情进行判断,实现(xiàn)更高(gāo)效、更准确的诊断。

    X射线和CT影像(xiàng)都能为(wéi)AI辅助诊断提供有效信息(xī),其中包括X胸片中的(de)异样(yàng)、基于CT影像(xiàng)的新冠状病毒分类以(yǐ)及与其他类(lèi)似肺炎的区分,同时(shí)还包括病情严重性评估的辅助手段。下表展示了(le)目前AI辅助诊断疫情的最新研究,涉及了病情分类(lèi)、严(yán)重性(xìng)评估等方(fāng)面。

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    在AI辅助下(xià),诊断的精度和速(sù)度(dù)得以大幅提(tí)升,宝贵的医疗资源也可以得到有(yǒu)效利用。此外,在病(bìng)程进(jìn)展(zhǎn)的后(hòu)续研究,包括肺部病(bìng)变区(qū)域的变化与病程的(de)关系等方面(miàn),AI技术也为后续(xù)的治疗以及疾(jí)病规律的研究(jiū)提供了(le)宝贵数据。

    新(xīn)冠(guàn)状病毒的相关数据集

    算法的(de)开(kāi)发和训练离不开数据的支撑(chēng)

    一下(xià)是COVID-19 CT分割数据集,包含(hán)60位患者的100个轴切面数据。

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    虽然这(zhè)些数据的数量和质量(liàng)都还远远不(bú)能满足AI算法的(de)需(xū)求,但随着人们对于疫情(qíng)的认识和数据的(de)汇总整理,相(xiàng)信更多的数据会源源不断(duàn)的被整理开(kāi)放出来。

    在突如(rú)其来的新冠肺炎面(miàn)前(qián),人(rén)工(gōng)智能在抗击疫情中发挥出了重要的作用,也进(jìn)一(yī)步显示了人工智能对于各(gè)个行(háng)业的重要作用。相信(xìn)拥有强有力(lì)的AI武(wǔ)器,我们将能更快的战胜(shèng)病(bìng)魔,取得抗疫的最终(zhōng)胜利!

    关键(jiàn)词(cí):




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